Los trasplantes de microbiota fecal son el tratamiento más eficaz y asequible para las infecciones recurrentes por Clostridioides difficile, una bacteria oportunista y la causa más común de infecciones intestinales adquiridas en hospitales. Sin embargo, los intentos de tratar enfermedades crónicas no transmisibles como la colitis ulcerosa y el síndrome metabólico mediante el trasplante de microbiota fecal (FMT) han arrojado resultados mixtos. Dos artículos de revisión publicados el 10 de mayo en la revista Cell Host and Microbe analizan lo que sabemos y lo que no sabemos acerca de por qué funcionan los FMT (cuando lo hacen).

Ambos equipos de investigación están de acuerdo en que necesitamos saber más sobre cómo varios factores poco explorados, como la dieta y los antecedentes genéticos del paciente, qué tan cerca la composición microbiana del donante coincide con el microbioma existente del paciente y la presencia de intestino no bacteriano habitantes como hongos y virus, afectan el éxito de FMT.

« Para profundizar nuestra comprensión de los mecanismos FMT y establecer la causalidad, los ensayos de intervención humana que utilicen no solo heces, sino también derivados de heces con composiciones y características definidas, o con un consorcio definido de componentes bacterianos, virales y metabólicos solos o en combinación, servirán como un importante plataforma experimental », escribe Abbas Yadegar, microbiólogo de la Universidad de Ciencias Médicas Shahid Beheshti en Irán y autor principal de la primera revisión.

« Se espera que la aplicación de tecnologías de vanguardia para la evaluación del microbioma, junto con los cambios en la visión actual de los trasplantes fecales, mejoren los protocolos y los resultados de FMT », escribe Serena Porcari, gastroenteróloga de la Fondazione Policlinico Universitario Gemelli y la Università Cattolica del Sacro. Cuore, quien dirigió la segunda revisión.

La mayor parte de la investigación de FMT se ha centrado en el componente bacteriano del microbioma, pero los virus y los hongos también podrían desempeñar un papel. Un estudio que trasplantó material fecal estéril (es decir, libre de bacterias) sugirió que las bacterias podrían ni siquiera ser necesarias para que un trasplante trate con éxito la C. difficile. El papel de los hongos ha recibido incluso menos atención, pero la presencia de Candida en donantes o receptores se asocia con una eficacia reducida del tratamiento.

Pensar más en cómo elegimos a los donantes y los emparejamos con los pacientes puede mejorar los resultados del trasplante, dicen los investigadores. Históricamente, los científicos y los profesionales médicos simplemente elegían donantes « sanos », pero ambos grupos de investigación afirman que los análisis taxonómicos y metabólicos a escala fina de los microbiomas del donante y del receptor ayudarían en la toma de decisiones clínicas, especialmente cuando se tratan otras enfermedades además de la infección por C. difficile.. Incluso puede justificarse un enfoque personalizado para elegir parejas de donante-paciente, aunque se necesita más investigación.

« Si bien algunos estudios respaldan la existencia de características compartidas que conforman los ‘súper donantes’, otros encontraron que el donante óptimo es más específico para cada paciente, lo que exige estrategias de selección personalizadas con la ayuda de herramientas de secuenciación de microbiomas, en lugar de un ‘donante único’. taburete se adapta a todos », escriben Porcari y sus colegas.

« Emparejar combinaciones de donante y receptor en función de sus patrones y preferencias dietéticos podría optimizar aún más la eficacia, porque la microbiota del donante estaría preadaptada a la dieta del receptor », escriben Yadegar y sus colegas.

En última instancia, una vez que comprendamos los mecanismos detrás del éxito de FMT, Yadegar y sus colegas argumentan que deberíamos usar esa información para diseñar nuevas terapias estandarizadas para reemplazar las FMT. « Aunque son altamente efectivos, existen inconvenientes sustanciales con los trasplantes de microbiota fecal, incluidos los riesgos infecciosos y escasos datos de seguridad a largo plazo », escriben los autores. « Por lo tanto, se desean mejores opciones de tratamiento para las infecciones recurrentes por C. difficile que sean específicas, seguras e independientes del donante ».

El equipo de investigación de Gianluca Ianiro (al que pertenece el Dr. Porcari) es optimista de que podríamos refinar los FMT como terapia para otras enfermedades, aunque todavía tenemos algunos obstáculos que superar primero. « Más allá de las mejoras en las tecnologías, creemos que se necesitan algunos cambios de mentalidad para promover los FMT como una posible opción de tratamiento para los trastornos no transmisibles », escriben los autores.

Estos cambios de mentalidad incluyen el reconocimiento de la necesidad y la implementación de análisis microbianos en profundidad de los microbios del donante y del paciente, yendo más allá del paradigma de los FMT como una terapia aguda de un solo uso.

« Las respuestas a los FMT generalmente no se mantienen a largo plazo para los trastornos crónicos no transmisibles », escriben Porcari y sus colegas. « Por lo tanto, los trasplantes secuenciales se han aplicado en este entorno con resultados prometedores, lo que sugiere que la modulación crónica del microbioma del paciente puede ser beneficiosa en los trastornos crónicos no transmisibles ».