Un nuevo estudio nacional, dirigido por investigadores del Tufts Medical Center en Boston, descubrió que la secuenciación del genoma completo (WGS) es casi dos veces más efectiva que una prueba de secuenciación de genes dirigida para identificar anomalías responsables de trastornos genéticos en recién nacidos y bebés. El estudio, « Un análisis comparativo de la secuenciación genómica completa rápida y un panel de genes neonatales específicos en bebés con un trastorno genético sospechado : el estudio de medicina genómica para recién nacidos e infantes enfermos (GEMINI) », se publicó por primera vez en línea en The Journal of the American Sitio web de la Asociación Médica (JAMA) el 11 de julio de 2023.
Financiado por los Institutos Nacionales de Salud, el estudio GEMINI, el primero de su tipo, inscribió a 400 recién nacidos y bebés menores de un año, con una amplia variedad de trastornos genéticos sospechados y no diagnosticados, en seis centros de los Estados Unidos. Cada recién nacido/bebé recibió WGS, que puede identificar variantes en los 20 000 genes del cuerpo humano, y NewbornDx, una prueba de secuenciación de genes específica que puede identificar variantes en 1722 genes que se sabe que están relacionados con trastornos genéticos en recién nacidos/bebés. Los investigadores encontraron que WGS detectó un trastorno genético en el 49 por ciento de los pacientes, mientras que la prueba de secuenciación de genes específicos identificó un trastorno genético en el 27 por ciento de los participantes del estudio. El panel objetivo omitió el 40 por ciento de los diagnósticos que capturó WGS. Además, los investigadores también encontraron 134 nuevos diagnósticos genéticos que nunca antes se habían descrito. En general, al 51 por ciento de los pacientes del estudio se les diagnosticó un trastorno genético con cualquiera de las pruebas.
« Más de la mitad de los bebés de nuestro estudio tenían un trastorno genético que habría pasado desapercibido en la mayoría de los hospitales de todo el país si no fuera por las tecnologías de secuenciación del genoma », dijo Jonathan Davis, MD, jefe de medicina neonatal en Tufts Medical Center and Co- Investigador principal del estudio. « Diagnosticar con éxito el trastorno genético de un bebé lo antes posible ayuda a garantizar que reciba la mejor atención médica. Este estudio muestra que WGS, aunque aún es imperfecto, sigue siendo el estándar de oro para el diagnóstico preciso de trastornos genéticos en recién nacidos y bebés ».
Pero WGS no deja de tener sus desventajas, anotaron los investigadores. En promedio, se necesitaron casi dos días completos más (seis días frente a cuatro días) para recibir resultados de rutina de WGS en comparación con la prueba de secuenciación de genes específicos. La prueba dirigida también es menos costosa y, dado que detecta trastornos genéticos específicos que solo aparecen en recién nacidos y bebés, su uso elimina el riesgo de revelar involuntariamente riesgos potenciales para la salud más adelante en la vida, como la enfermedad de Alzheimer o el cáncer, que los padres del niño puede que no quiera saber.
El Estudio GEMINI también identificó una preocupación adicional : la falta de estandarización en la interpretación de la genética neonatal. En el 40 por ciento de los casos, diferentes laboratorios discreparon sobre si una anormalidad genética mutuamente reconocida era la causa del presunto trastorno genético en el recién nacido/bebé.
« Muchos neonatólogos y genetistas usan paneles de secuenciación del genoma, pero está claro que hay una variedad de enfoques diferentes y una falta de consenso entre los genetistas sobre las causas del trastorno médico de un paciente específico », dijo Jill Maron, MD, MPH, Jefa de Pediatría de Women & Infants Hospital of Rhode Island y co-investigador principal del estudio. « La secuenciación del genoma puede ser costosa, pero en esta población específica en riesgo, demuestra ser muy informativa. Apoyamos los esfuerzos en curso para ver estas pruebas cubiertas por el seguro ».
Los sitios de estudio adicionales incluyen el Hospital Infantil Rady en San Diego, el Hospital Mt. Sinai, la Universidad de Carolina del Norte-Chapel Hill, el Hospital Infantil de Cincinnati y la Universidad de Pittsburgh.
« Este estudio proporciona más evidencia de que los trastornos genéticos son comunes entre los recién nacidos y los bebés », dijo Stephen F. Kingsmore, MD, DSc, presidente y director ejecutivo del Rady Children’s Institute for Genomic Medicine y coinvestigador y segundo autor del estudio. « Los hallazgos fortalecen el apoyo para el diagnóstico temprano mediante la secuenciación genómica rápida, lo que permite el uso de la medicina de precisión para una mejor atención a esta población vulnerable de pacientes ».
El estudio GEMINI está respaldado por una subvención del Centro Nacional para el Avance de las Ciencias Traslacionales (NCATS) de los Institutos Nacionales de Salud (NIH) al Centro Médico Tufts, con el número de concesión U01TR00271. Los autores señalan varias limitaciones y conflictos de intereses, que se describen en el estudio.