La Red Internacional Euglena (EIN), fundada en 2020, es un consorcio global de cientos de científicos de todo el mundo con el objetivo colectivo de apoyar la ciencia euglenoidea a través de ómicas colaborativas e integradoras entre académicos y la industria.

El EIN (https://euglenanetwork.org/) ha publicado hoy un documento de posición en Biology Open, que describe el caso de un esfuerzo concertado para generar genomas de referencia de alta calidad para las casi 1000 especies conocidas de euglenoides.

Los euglenoides son parte del grupo de los protistas, hogar de organismos eucariotas que no encajan en los grupos de animales, plantas u hongos. Estos diversos organismos unicelulares se encuentran en una gama excepcionalmente amplia de ecosistemas en todo el mundo.

Múltiples especies de euglenoides tienen aplicaciones traslacionales, mostrando una gran promesa en la producción de biocombustibles, nutracéuticos, biorremediación, tratamientos contra el cáncer e incluso como simuladores de diseño de robótica.

Su enorme potencial se ha desaprovechado en gran medida debido a la falta de genomas de referencia de alta calidad.

Los genomas euglenoides presentan un desafío de secuenciación particular porque son un ejemplo de endosimbiosis secundaria : albergan mitocondrias, cloroplastos y restos de material genético de los organismos que envolvieron para adquirir estos orgánulos.

Su enorme potencial se ha desaprovechado en gran medida debido a la falta de genomas de referencia de alta calidad.

Los genomas euglenoides presentan un desafío de secuenciación particular porque son un ejemplo de endosimbiosis secundaria : albergan mitocondrias, cloroplastos y restos de material genético de los organismos que envolvieron para adquirir estos orgánulos.

Como resultado, se han explorado menos de 20 especies a cualquier nivel en busca de potencial traslacional a través de la genómica. El EIN cree que es el momento adecuado para abordar esto.

Mediante la generación de genomas de referencia de alta calidad para las especies conocidas de euglenoides, la EIN trabajará para :

  • Comprender la biología básica de los euglenoides
  • Comprender la evolución de los euglenoides
  • Maximizar las aplicaciones euglenoides en la gestión ecológica y ambiental
  • Explore, traduzca y comercialice productos euglenoides

Los datos recopilados por EIN estarán disponibles abiertamente para la comunidad científica a través del Archivo Europeo de Nucleótidos (ENA). Una vez en ENA, los genomas anotados pueden importarse a recursos como Ensembl Protists y presentarse de manera uniforme y JUSTA a las comunidades de investigación.

El Dr. ThankGod Echezona Ebenezer, presidente fundador de EIN y bioinformático en el Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI), Reino Unido, dijo : «La Red Internacional Euglena desempeñará un papel crucial para ayudar a reunir especialistas en euglenoides para aumentar nuestra comprensión de biología de los euglenoides y sus aplicaciones traslacionales. Esto podría ser útil para ampliar nuestra comprensión de la evolución del parasitismo, los juegos sociales, el desarrollo de combustibles para aviones o el apoyo a la exploración espacial humana».

El profesor Neil Hall, presidente del Comité Científico de EIN y director del Instituto Earlham, dijo : «Es increíblemente raro encontrar un organismo tan versátil que tenga funciones potenciales en la producción de alimentos, la generación de biocombustibles, la ingeniería robótica y el desarrollo de fármacos, y allí hay muchas más aplicaciones posibles. La producción de genomas de referencia es el primer paso para comprender estos notables organismos para que podamos darnos cuenta de su potencial biotecnológico».

El Dr. Masami Nakazawa, miembro del Comité Científico de EIN y profesor titular en la Universidad Metropolitana de Osaka, Japón, dijo : «EIN ha impulsado colaboraciones en la comunidad euglenoidea donde ya estoy involucrado en proyectos interesantes relacionados con el metabolismo energético. Elucidar características inexploradas de Los euglenoides, incluida la información genómica, contribuirán al bienestar humano a través de la biotecnología además de la ciencia básica».

La Dra. Anna Karnkowska, miembro del Comité Científico de EIN y profesora asistente de la Universidad de Varsovia, Polonia, dijo : «Las características genómicas únicas y la presencia de plástidos secundarios en los euglenoides los convierten en un grupo crucial para comprender la evolución de los eucariotas y su sistema endosimbiótico». orgánulos Los datos genómicos son esenciales para dilucidar la historia evolutiva de los euglenoides y diseñar experimentos para explorar más su biología».

El Dr. Eric W. Linton, miembro del Comité Científico de EIN, expresidente de la Sociedad Americana de Ficología (PSA) y profesor de la Universidad Central de Michigan, EE. UU. dijo : «La información genómica que tenemos para los euglenoides muestra su «Los genomas y las vías bioquímicas/metabólicas resultantes, en muchos casos, están formados por genes de diversas fuentes, como bacterias, algas rojas y verdes. Esta quimera de un genoma puede brindarnos información poco común sobre la evolución, organización y regulación del genoma».

La Red Internacional Euglena es una red afiliada al Proyecto BioGenoma de la Tierra y la Sociedad Internacional de Protistólogos.